Симптомы проявляются на всех надземных частях растения. Первые признаки болезни можно обнаружить на всходах в виде коричневато-желтых пятен на семядольных, молодых настоящих листочках и стеблях. Это спермогониальная стадия. Через 2—^3 дня на спермогониальных пятнах и около них образуются выпуклые лимонно-желтые скопления эпидиопустул с эцй-диоспорами. Эти весенние стадии трудно обнаружить в посевах льна. Наиболее заметна и широко распространена летняя стадия гриба—уредостадия. В период бутонизации— цветения на листьях и стеблях растений появляются довольно крупные ярко-оранжевые порошащие «подушечки» уредостадии. При сильном развитии заболевания льняное поле приобретает оранжево-красный оттенок. Листья на сильно пораженных растениях преждевременно желтеют, опадают.
