Борьбу с головней проса ведут путем заблаговременного обеззараживания посевного материала гранозаном (1 кг/т), меркур-бензолом (1—1,5 кг/т) или предпосевной обработки формалином влажным или полусухим способом (0,33 л/т).
Система мероприятий по борьбе с головней зерновых культур. Защита зерновых от головни включает общеагротехпические и специальные мероприятия по обеззараживанию семян. Апробация семенных посевов — важное мероприятие по выявлению зараженности разными видами головни. Она дает производственную характеристику устойчивости культур и сортов к заболеванию, оценивает эффективность предшественников, удобрений, протравителей. Посевы переводят из семенных в товарные, если зараженность, их пыльной головней пшеницы и ячменя больше 2%, остальными видами головни больше 5%. На элитных посевах зерновых головня недопустима.
Обработка почвы и глубина заделки семян влияют на развитие заболевания. Так, при зяблевой вспашке споры перемещаются на большую глубину в почву и теряют способность к заражению.
